在摄政脱烈哥那的统治下，朝廷内部出现了重用不学无术之人、结党营私和排除异己的现象。法提玛原本是波斯的徒思人，被俘后成为了脱烈哥那哈敦斡尔朵的一员，不务正业却常与脱烈哥那亲近。她与脱烈哥那曾经联合策划逮捕中书右丞相镇海和燕京行台断事官牙老瓦赤。镇海和牙老瓦赤得知后逃往阔端斡尔朵寻求庇护，中书令耶律楚材含怨而死。大商人奥都剌合蛮被派往中原接替牙老瓦赤职务。
脱烈哥那的摄政导致成吉思汗《札撒》废弃，使得法度不一。诸王四处派遣使臣滥发诏旨牌符，各自结党为政（志费尼《世界征服者史》），几乎使蒙古帝国崩溃。篡权夺位期间，窝阔台汗指定阔出的儿子失烈门为继承人，但窝阔台死后，脱烈哥那违背其意愿立自己的儿子贵由为汗。
1246年7月，在拔都等宗亲未到前，脱烈哥那就以自己的权力立贵由为合罕。但是，由于贵由多病难以料理朝政，其实际掌控者是右丞相镇海及断事官哈达。在脱烈哥那和法提玛的合谋下，镇海逃奔至阔端避难。而贵由即位时，以谋害阔端罪处决了法提玛，并重新任命镇海为右丞相，同时处死了奥都剌合蛮，并让牙老瓦赤继续主持中原地区的事务。
为了确保法度统一，贵由下诏收回散发的牌符，对诸王颁发敕令进行限制；对窝阔台制定的法律条文进行保护。此外，他将管理突厥及河中的政治权力交给马思忽惕，让额勒只统治鲁木、格鲁吉亚，将绰儿马罕军卒归属额勒只，并要求每10户抽2人充当把阿图儿军从征；又将管理波斯及阿塞拜疆权限交给阿儿浑。
察合台长子木图干在战争中阵亡，其子哈剌斡忽剌被指定继承人的位置。当察合台去世后，其嫡子也速-蒙哥想成为大汗，但哈剌斡忽剌拒绝其参与朝政。因此，当也速-蒙哥君临察合台汗国时，这个决定便来自于贵由。
1248年，在迁移至叶密立-忽真的途中病逝之前，只执掌三年的时间里，大部分朝政都是乃马真后的手笔。在太宗去世之后，她作为摄制国家五年，最终会同百官推举定宗登基。在她去世后，她被追谥昭慈皇后并升祔太宗庙，而她的形象则在2013年的电视剧《建元风云》（忽必烈传奇）中有所展现，其中蔡雯艳饰演乃马真（即乃马真后的别名）。
