摄政脱烈哥那在掌权后，结党营私，排除异己，将一批不学无术的人任命为朝廷内的高官。法提玛本是波斯人，被俘至哈剌和林后，不务正业，但常与脱烈哥那近侍接近。在脱烈哥那摄政期间，他倾心于哈敦的斡尔朵（宫殿）。因此，当脱烈哥那掌权，他便与之密谋逮捕中书右丞相镇海和燕京行台断事官牙老瓦赤。镇海、牙老瓦赤得知此事后逃奔到阔端斡尔朵寻求庇护。中书令耶律楚材也含怨而死。大商人奥都剌合蛮被派往中原，接替了牙老瓦赤的职位。
脱烈哥那的摄政导致成吉思汗《札撒》遭废弃，使法度不一。诸王们四面派遣使臣，滥发诏旨牌符；他们各自结党为政（志费尼《世界征服者史》），几乎让蒙古帝国走向崩溃。
篡位夺位窝阔台汗在位时曾指定阔出的儿子失烈门为汗位继承人。但窝阔台去世后，脱烈哥那违背其生前意愿，决心立自己的儿子贵由为汗。在1246年七月，一次大会上，由于拔都和宗亲未到场前，脱烈哥那及异密们就以自己的力量立了贵由为合罕。这标志着黄金家族内部纷争开始。此时贵由因病多难以处理朝政，其实际政治影响力很小，而朝纲事务主要依赖右丞相镇海和断事官哈达处理。
在脱烈哥那与法提玛的阴谋下，镇海逃奔到阔端处幸免于难。贵由登基时，以谋害阔端罪处死了法提玛，并重新任命镇海为右丞相；又处死了奥都剌合蛮，并继续交给牙老瓦赤主持中原地区的事务。他还下令收回诸王散发的牌符，以及规定诸王不能擅自颁布敕令，对窝阔台制定的法律条文不得改动或损益增删等。此外，他将管理突厥和河中的政务交给马思忽惕，让额勒只统治鲁木、格鲁吉亚，将绰儿马罕军卒归属额勒只，每10户抽2人充当把阿图儿军从征，还将统治波斯及阿塞拜疆的权力授予阿儿浑。
察合台长子木图干战死，其子哈剌斡忽剌被指定继承察合台汗国 throne. 察合台去世后，其嫡孙也速-蒙固希望成为新君，但哈剌斡忽剌阻止他参与朝堂活动。贵由即位后认为有孙子，便决定让也速-蒙固去监管察合台汗国。一年之后，即1248年，在迁移途中的路上，因病身亡仅执政三年。
元史·列传第一·太宗昭慈皇后的记载显示，她名乃马真氏，是大太宗生母，也是定宗之母。她临终前五年摄理国家事务，最终定宗被推举成为新君。在她去世后的第二年，她追谥号称慈皇后，并入葬太宗陵寝。这段历史也反映出乃马真对蒙古帝国政治影响深远的一面，如同电视剧《建元风云》（忽必烈传奇）2013年的演绎那样——蔡雯艳扮演乃马真，这个角色展示了她的智慧、勇气以及对国家稳定的贡献，为她赢得了一片赞誉。而她的名字也是历史上的一个重要缩影：乃马真资料显示，她是一名蒙古帝国皇后的身份，也是著名历史人物之一。她留下的遗产不仅包括政治上的贡献，更是在文化艺术领域留下深刻印象的一个女性形象。她最著名的是作为“昭慈皇后的”这一称号所展现出来的心地宽厚和对社会公正的大度，这种形象一直流传至今，让人们感受到一种温暖与智慧，同时对于她的才华、坚韧精神也有着敬仰之情。
