在摄政脱烈哥那的统治下，朝廷内部出现了重用不学无术之人、结党营私和排除异己的现象。法提玛原本是波斯的徒思人，被俘后成为了脱烈哥那哈敦斡尔朵的一员。他经常接近脱烈哥那，权倾一时，有一次甚至与他合谋逮捕中书右丞相镇海和燕京行台断事官牙老瓦赤。镇海和牙老瓦赤得知后逃奔到阔端斡尔朵寻求庇护，中书令耶律楚材也含怨而死。大商人奥都剌合蛮被派往中原接替牙老瓦赤的职务。
脱烈哥那摄政期间，使得《札撒》遭废弃，导致法度不一。诸王纷纷派遣使臣四处滥发诏旨牌符，以此结党自立（志费尼《世界征服者史》），蒙古帝国濒于崩溃。这段时间里，也埋下了贵由汗位继承人的种子。
当窝阔台汗去世后，尽管他生前指定阔出的儿子失烈门为继承人，但脱烈哥那违背这一意愿决定立自己的儿子贵由为汗。在1246年7月之前，即将推举新大汗时，由于拔都等宗亲尚未到达会议地点，脱烈哥那便利用自身的力量宣布贵由为新大汗。然而，这一决策却引起了黄金家族内部的争斗，并且由于贵由多病难以处理国事，大权实际上掌握在右丞相镇海及断事官哈达手中。
随着脱列哥那和法提玛之间的关系恶化，他们最终阴谋害死了法提玛，并重新任命镇海为右丞相。此外，他们还处死了奥都剌合蛮，并继续让牙老瓦赤管理中原地区的事务。而为了确保法律统一性，贵由发布了一系列命令，如收回散发出去的牌符，不许诸王擅自颁布敕令，对窝阔台制定的法律条文也不允许任意更改或损益增删等。
在这段混乱时期内，还有其他重要的人物活动，比如木图干在攻占范延堡战争中的阵亡，其子哈剌斡忽剌被指定为察合台汗国继承人。但是在察合台去世后，他嫡子的也速-蒙哥并未获得参与朝政机会，而是被派往察合台汗国君临。在1248年，当贵由迁移斡尔朵途中病逝之后，他仅执政三年。不久后的太宗昭慈皇后的乃马真后，在她的摄政期间对国家进行了一系列改革，最终功成身退，她也是元史·列传第一·后妃之一，被追谥“慈皇后”，升祔太宗庙。
