在新冠肺炎疫情的突如其来的打击下，吴尊友从幕后的科研工作者一跃而为台前的防控专家。他作为中国疾病预防控制中心流行病学首席专家，自2020年初疫情爆发以来，在关键时刻总能给社会带来信心和安心。他的工作不仅涉及新冠肺炎的防控，还包括了对艾滋病等传染病的研究和防治。
正是因为他在这些领域的卓越贡献，吴尊友荣获了2021年“最美科技工作者”的称号，这一荣誉由中宣部、中国科协等六部门联合颁发。
在北京疫情期间，吴尊友的一番话让人惊讶：“我可以明确地告诉大家：北京疫情已经控制住了！”这句话背后，是他对数据和防控措施精准分析与判断的结果。在接下来的时间里，北京确实实现了“零增长”，许多人对他的分析表示赞赏。
对于新发地疫情发生的情况，吴尊友带领团队进行了职业分类，并通过环境采样发现污染严重的地方主要集中在水产和牛羊肉大厅。他们认为，这些地方低温湿度适合病毒存活，从而成为传播风险增加的一个因素。
随着大连疫情的发生，与海产品加工销售有关的事故再次证明了这一点。通过综合运用多种技术，如大数据分析、流行病学调查以及基因测序比对，他们认定海产品及外包装污染、冬季国际物流等是引发输入性新冠病毒疫情的新方式。
尽管检测结果最初显示所有样本为阴性，但由于吴尊友提出的建议进行复检，最终发现从亚洲某些国家进口冷冻水产品中的核酸阳性样本。这次工作被认为规避了一次可能导致新的COVID-19疫情风险，因此具有很高意义。
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