朱祐樘的早逝，一个谜团一直悬而未解。据说他成为了皇帝后，一直尽职尽责，努力维持着明朝即将崩溃的江山。他希望能带领明朝从衰退中复苏，这一努力似乎在一定程度上成功了，被誉为“弘治中兴”。尽管不能说他有非凡的功绩，但他的表现是众所周知的。
朱祐樘在位十八年，当时仅仅三十六岁，对于他的死因，有多种不同的说法。有些人认为他得了热病，因为太医没有给予有效治疗，而其他人则指责宫廷中的谋杀。但这些说法并没有得到充分证实。
还有些人认为，他可能因为生前身体状况不佳，最终导致了早逝。这一点可以从他的童年环境来看。当时，他母亲已经被软禁在冷宫，自己的健康状况也不好。因此，朱祐樘自幼就缺乏营养，从小到大都受到宦官和婢女共同抚养，没有充足的食物供应，这也许对他的健康造成了一定的影响。
《明史》记载，在临终前，朱祐樘还曾召见大臣嘱咐他们要好好地辅助皇太子。这显示出他临死前的清醒意识，即使是在死亡前夕，他还是能够理智地思考未来的事宜。如果真的遭到了暗害，那么应该会留下一些迹象，但同时，也表明他有意无意地托付重臣照顾皇太子，不太可能存有怀疑之心。
值得注意的是，在历史上，大多数明朝皇帝寿命都不长，只有两位例外——朱元璋和成祖，其余的大多数只活到三四十岁左右，与此相符的是当时的平均寿命也是如此短暂。而朱祐樘虽然做了较短时间的皇帝，但仍对明朝作出了显著贡献，并且是唯一推行一夫一妻制的人选。在与其妻张皇后的忠贞关系中，我们看到了一份感情上的亮点，即使在繁忙和责任重大的生活中，他们依然保持着彼此间的情感纽带，这对于一个君王来说，是非常不易的事情。
