脱烈哥那摄政后，结党营私，排除异己，任命了一批不学无术的人担任朝廷内部的命官。法提玛本是波斯徒思人，被俘虏到哈剌和林后，不务正业，但经常接近脱烈哥那哈敦的斡尔朵（宫殿）。所以，当脱烈哥那摄政后，他权倾一时，曾与脱烈哥那合谋逮捕中书右丞相镇海和燕京行台断事官牙老瓦赤。镇海、牙老瓦赤得知后，逃奔到阔端斡尔朵，寻求其庇护。中书令耶律楚材也含怨而死。大商人奥都剌合蛮却被派往中原，接替牙老瓦赤的职务。
脱烈哥那的摄政，使成吉思汗《札撒》遭到废弃，造成法度不一。诸王人人都向四方派遣使臣，滥发诏旨牌符；他们四下结党，都各自为政（志费尼《世界征服者史》），使蒙古帝国濒于崩溃境地。
篡权夺位，在窝阔台汗去世之后，由于失烈门被指定为继承人，而脱烈哥那违背了窝阔台汗生前意愿，将自己的儿子贵由立为汗。在1246年7月的一次会议上，即在拔都和宗亲们未能出现在之前，由于一些人的策划，他们用自己的力量立了贵由为合罕。这导致黄金家族内部产生了纷争，并且由于贵由身体虚弱，对国家大事处理不足，因此许多重要决策实际上都是由右丞相镇海、断事官哈达负责制定。
在此期间，有一次因为法提玛与贵由勾结并谋害了阔端，这导致法提玛被处死，并重新任命镇海为右丞相。此外，还有奥都剌合蛮因罪被处决，同时仍然让牙老瓦赤继续主管中原地区的事务。
为了确保法律统一性，大汗贵由下达了一系列命令，其中包括收回散发出去的牌符，不允许诸王擅自颁布敕令，以及保护成吉思汗所制定的法律条文不受改变或损益。此外，他还将管理突厥和河中的责任交给马思忽惕，并把管理波斯及阿塞拜疆的权力交给阿儿浑等人物。
察合台长子木图干在战场上英勇牺牲，其子哈剌斡忽剌继承父位。但当察合台去世时，其嫡孙也速-蒙哥希望成为新的大汗，但哈剌斡忽剌拒绝让他参与朝廷事务。大汗贵由认为自己在世时不能让孙子继承，所以决定派也速-蒙哥去统治察合台之国。在1248年，大汗贵由病逝，只执掌大印三年的时间。他去世之后，被追谥“昭慈皇后”，并升祔太宗庙。而他的妻乃马真，则因其卓越贤惠以及对国家稳定的贡献而受到赞誉。她也是中国历史上少有的女性政治家之一，也是一位杰出的女强人，她通过她的智慧和坚韧无比地支持丈夫，从而帮助维护了蒙古帝国的稳定与发展。
