在2013年7月，多特蒙德足球俱乐部以2500万欧元的高价签下了亨里克·姆希塔良。转会后，他迅速成为球队的核心力量，在欧冠和德甲比赛中表现出色，帮助球队从死亡之组中脱颖而出。在2014年的德国超级杯中，姆希塔良的贡献直接导致多特蒙德获得冠军头衔。此后的赛季，他继续保持着稳定的状态，在2015-16赛季期间代表多特蒙德出场51次，并攻入23球助攻32次，成功获得了那一赛季的最佳助攻奖。
随后在2016年7月，他加盟了曼彻斯特联，并表示这是他梦想成真的时刻。他很快就在曼联取得了一席之地，并在对阵莱斯特城的一场比赛中的个人秀进球被评为最佳进球，这是他连续第三个月获得这一荣誉。
然而，在2018年1月23日，姆希塔良又开始了一段新的旅程，从曼联转投阿森纳足球俱乐部。在那里，他不仅赢得了亚美尼亚足球先生称号，还两度当选为阿森纳三月份的最佳球员。
到了2019年9月2日，姆希塔良再次换装，一直租借加盟意甲俱乐部罗马。他在罗马展现出了强大的实力，但2020年1月5日受伤让他的征途暂时中断。尽管如此，这位天才型前腰已经证明了自己的价值，无论是在哪个舞台上都能发挥出色的表现。
